Afdeling for Data Science og AI i Sundhed på Statens Serum Institut søger en ph.d.-studerende til at indgå i et projekt om ”Afdækning af smittespredning for antibiotikaresistente infektioner ved at studere patientoverførsler mellem hospitalsafdelinger” gennem netværksanalyse, avanceret biostatistik og AI.

Om projektet
Antibiotikaresistens er voksende trussel mod global sundhed som underminerer effektiviteten af livsvigtige antibiotikabehandlinger. Selvom Danmark fortsat har en lav forekomst af antibiotikaresistens, udgør resistente bakterier en væsentlig udfordring i sundhedsvæsenet. Danske hospitaler har hver dag et stort antal patienter og udfører mange operationer. Det skaber komplekse mønstre af patienttrafik mellem afdelinger og dermed også potentielle veje for smittespredning, som er svære at gennemskue uden de rette analyseværktøjer. Forskningsprojektet har til formål at opbygge et komplet netværk over patienttrafik mellem hospitalsafdelinger og finde de afdelinger der spiller en særlig rolle i smittespredningen af antibiotikaresistente bakterier. Dette skal gøres ved hjælp af netværksanalyse, avanceret biostatistik, og AI. Der anvendes data fra de danske sundhedsregistre herunder Sundhedsvæsenets Organisationsregister og den danske mikrobiologidatabase. Desuden bygges på erfaring fra svenske netværksanalyser ved et samarbejde med Karolinska instituttet og de svenske sundhedsmyndigheder. Som det sidste trin i projektet skal en AI-algoritme trænes på historiske data for at identificere de afdelinger, der spiller en særlig rolle i smittespredningen. På længere sigt skal projektet bidrage til forbedret forebyggelse ved at målrette indsatser som screening, infektionshygiejne og rationel antibiotikaanvendelse.

Din baggrund
For at komme i betragtning til stillingen forventer vi, at du har:

• En kandidatgrad i Kvantitativ Biologi og Sygdomsmodellering eller tilsvarende med et statistisk, mikrobiologisk, og data science perspektiv.
• Dokumenteret erfaring med arbejde med danske sundhedsregistre og mikrobiologiske laboratoriedata (fx MiBa) samt koblede registerudfald.
• Stærke statistiske og programmeringsmæssige kompetencer (R og/eller Python), herunder håndtering af databaser, storskalaregisterdata og reproducerbare workflows.
• Dokumenteret erfaring med arbejde med smittefremskrivningsmodeller
• Erfaring med AI og maskinlæring
• Viden om mikrobiologiske sekvensdata
• Gode samarbejds- og kommunikationsevner på engelsk og dansk, både skriftligt og mundtligt.

Derudover vil det være en fordel, hvis du har fagfællesbedømte publikationer inden for epidemiologi/sundhedsvidenskab baseret på registerdata.

Om afdelingen
Data Science og AI i Sundhed er en afdeling under Epidemiologisk Infektionsberedskab på Statens Serum Institut (SSI). Et fokusområde for afdelingen er at forstå årsager, udbredelse, og byrde af infektionssygdomme vha. store datamængder og avancerede algoritmer og analyser.

Afdelingen har ca. 25 medarbejdere, herunder læger, data scientists, biostatistikere, biologer, epidemiologer og administrativt personale – og derudover ph.d.-studerende.

Vi tilbyder
Vi tilbyder en stilling med et alsidigt og udfordrende indhold. Vi lægger vægt på at fremme et spændende fagligt miljø i samarbejde med dygtige og engagerede kolleger. I forbindelse med varetagelse af afdelingens opgaver er der potentiale for et enestående samarbejde på tværs af faggrænser, herunder inden for AI og Machine Learning.

Hverdagen på SSI er præget af mange forskelligartede opgaver, åbne døre og et bredt samarbejde med engagerede og dygtige kolleger. Du får mulighed for en fleksibel hverdag med en god balance mellem arbejde og fritid, da SSI er en arbejdsplads med en 37-timers arbejdsuge inkl. frokostpause, flekstidsaftale samt mulighed for hjemmearbejde afhængig af arbejdsopgaver / fleksibel arbejdstidstilrettelæggelse.

På SSI har vi en aktiv personale- og idrætsforening (IK-SERA) med holdtræning og motionslokaler, fredagsbar og forskellige sociale arrangementer – og vores Campus rummer endda både tennisbaner og egen børneinstitution. SSI er centralt beliggende i København med grønne arealer og gode offentlige transportmuligheder (bus og metro) og har fri parkering på området.

Om ansættelsen
Stillingen ønskes besat pr. 1. november 2026 for en tre-årig periode.

Du vil blive ansat som ph.d.-studerende med en ugentlig arbejdstid på 37 timer i henhold til gældende overenskomst mellem skatteministeriet og Akademikernes Centralorganisation, herunder Protokollat om ph.d.-stipendiater.

Kontakt os gerne Få mere at vide om stillingen ved at kontakte projektleder Peter Bager på PBG@ssi.dk .

Er du interesseret?
Klik på ”søg stillingen” og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis. Ansættelsessamtaler forventes afholdt i uge 36.